У меня комп на архитектуре ARM, java и javafx поставил, сам ланчер работает нормально, вот только он в ~/.cristalix/updates/jre-internal-linux64/bin скачивает зачем-то джаву для amd64 (или даже x86, не проверял) и пытается ее запускать. Разумеется, у него ничего не выходит. Сделайте опцию в лончере, чтобы можно было использовать системно установленную java?